先日、断熱剤を敷くために、シートを外して、再度付け直す際に、助手席シート後ろの右側のボルトが入らない事が発覚しました。
よく見るとねじ山がボルト側も凹側も一部潰れていました。
これは対処、修復可能なのでしょうか？

ねじ山が両方とも潰れてしまったとのことですが、タップとダイスというねじ山を切りなおす工具がありますのでそれを使えば修理可能です。
工具が高価だったり、作業に少しコツが必要なので修理工場様にお願いするのがいいと思います。