キャリーの4WDのミッション不良でリビルド品に交換を検討しているのですが、
今の車両がEBD-DA63Tの車両なのですが、前オーナーがLE-DA63Tのエンジンとミッションに
載せ換えをおこなっているみたいでどれを注文すればよいか悩んでいます。
LEとEBDでハウジングなどの違いがなければ車両情報のものを搭載したいと思っていますが。
どちらでもよいのでしょうか？ギア比などはこだわりはないので。。

現品と同じものを使用されることをお勧めします。

部品流用は理論上ついても現物合わせで取り付かない場合があるからです。