ドアキーがリモートで作動しなくなりました。
ボタン電池を新品に交換しましたが、治りません。
キーを直接運転席ドアの鍵穴に差し込んで回して使えば
問題ありませんが、リモートでは動作しません。
修理にどれくらいの費用かかるでしょうか？

実際には12年を経過していますので、修理するつもりは
ありませんが、次回の車検はそのままでも通りますか？
通らなければ直さなければなりませんが、費用対効果で
買い替えも視野に入れます。

運転席側のドアロックがキーレスで開閉しないのですね。

考えられる原因ですが、キーレス（トランスミッタ）本体の故障やドアロック・モーター（ドアロック・アクチュエータ）等の故障が考えられます。
修理費用ですがキーレス本体の故障の場合、部品代・書き込み工賃（新しいキーレスを車両に登録する作業）を含めて約￥10,000-くらいになります。
運転席側のドアロック・モーター（ドアロック・アクチュエーター）の故障であれば、部品代（￥5,350-）と工賃を含めますと約￥15,000-くらいです。

リモートでドアロックが作動しなくても安全上の問題はない部分ですので車検には問題なく通ります。
正確な故障個所、修理費用はプロの診断が必要になりますのでお近くの整備工場で点検してもらいましょう！